Odcinek 1

Kapitan Jack powraca, a oddział Torchwood zwiera szeregi, by walczyć ze zbuntowanym Agentem Czasu. Tajemniczy Kapitan John Hart zamierza siać zniszczenie, musi też znaleźć coś, co ukryto na Ziemi. Życie Gwen jest w niebezpieczeństwie, w całym mieście rozmieszczono bomby – po czyjej stronie jest Jack?

Odcinek 2

Gdy włamanie zamienia się w zabójstwo, oddział Torchwood podejrzewa, że w sprawę zamieszani są kosmici. Kim jest Beth? Czy rzeczywiście jest niewinna? Gdy śledztwo zmienia się w akcję, ogarniającą całe miasto, Jack zdaje sobie sprawę, że w niebezpieczeństwie jest cała nasza planeta.

Odcinek 3

Toshiko podoba się przystojny żołnierz, który zagubił się z dala od swych czasów. Nie wie on nawet, że ma klucz do ocalenia świata. W starym szpitalu straszą duchy z 1918 roku, zaś kryzys, który Torchwood przewidział niemal wiek wcześniej, ma właśnie osiągnąć apogeum. Strefy czasowe zaczynają się ze sobą zderzać, trzeba podjąć decyzje, od których zależy życie lub śmierć – czy oddziałowi uda się ocalić Cardiff?

Odcinek 4

Rhys odkrywa prawdę na temat Torchwood, zostaje więc częścią zespołu. Agenci prowadzą śledztwo dotyczące kosmicznych dostaw mięsa. Rhys znajduje się w coraz większym niebezpieczeństwie, Gwen pracuje więc w ogromnym napięciu. Czy Rhys posunie się za daleko? Czy Jack nie zażąda od niego zbyt wiele? I czy Torchwood zdoła ocalić kosmitów, którzy stają się tanim mięsem?

Odcinek 5

Do Torchwood dostaje się kosmita, który ma moc zmieniania wspomnień. Czy ekipie uda się przed nim uratować, zanim będzie za późno? Kapitan Jack gubi się we wspomnieniach o swej zaginionej rodzinie, Gwen nie może sobie przypomnieć Rhysa… Dopiero miłość Jacka do Ianto pomoże odnaleźć prawdę. Jak zawsze jednak, oddziałowi przyjdzie zapłacić za poznanie prawdy.

Odcinek 6

Kapitan Jack prosi Marthę Jones o pomoc w śledztwie dotyczącym pewnych tajemniczych zgonów. Trop wiedzie do złowrogiego centrum badań medycznych, Martha musi więc działać w ukryciu. Czyżby Torchwood źle ocenił centrum, które gotowe jest posunąć się bardzo daleko, byle dokonać kolejnych odkryć? Jak bezpieczni są oficerowie Torchwood?

Odcinek 7

Pogrążony w szoku Torchwood musi zmierzyć się z najgorszymi w swych dziejach wyzwaniami. Chcąc przywrócić porządek Kapitan Jack używa rękawicy ożywiającej, ale uwalnia tym samym pierwotną moc, która używa oddziału, by siać chaos na Ziemi. Wspomagają ją Weevilsi i ich nowoobrany Król.

Odcinek 8

Owen padł ofiarą nowej dla siebie sytuacji. Teraz jest przekonany, że potrzebuje odkupienia. Czy może mu pomóc samotna dziewczyna stojąca na dachu? A może jego misja, zmierzająca do odzyskania urządzenia Obcych okaże się zabójczo niebezpieczna? I jak daleko gotowa jest posunąć się Toshiko, by mu pomóc?

Odcinek 9

W noc przed ślubem Gwen stara się pogodzić pracę z pójściem na wieczór panieński. Niestety, kosmiczny "zmieniacz kształtów" sprawia, że dziewczyna musi na siebie wziąć więcej, niż zamierzała. Gdy wszyscy zbierają się, by świętować, Jack będzie musiał zakłócić jej wielki dzień – chyba, że któraś z trzech obecnych na uroczystości matek zdoła wymyślić coś, co go powstrzyma.

Odcinek 10

Gdy swe podwoje otwiera pewne stare kino, na ulice Cardiff wylegają dawne koszmary. Znalezione zostają ciała, ludzie balansują na granicy życia i śmierci, Torchwood nie może więc tracić czasu! Kim są Nocni Podróżni? I w jaki sposób Torchwood miałby schwytać tych tajemniczych zabójców?

Odcinek 11

Kiedy znika pewien nastolatek Gwen zbliża się do śledztwa, które ujawnia mroczną stronę natury Torchwood. Setki ludzi znikają bez śladu – więc czemu Jack utrudnia poszukiwania? Odpowiedź zdaje się leżeć w szczelinie. Dosłownie. Gwen już wkrótce czeka szokujące odkrycie.

Odcinek 12

Umiejscowione w budynku ładunki wybuchają, zespół zaś traci przytomność. Życie przewija się przed oczami agentów, my zaś dowiadujemy się, jak każdy z nich został zwerbowany: widzimy inicjację Kapitana Jacka do zaszokowanego Torchwood w roku 1899, śmiałą misję Toshiko, która postanowiła zdobyć kosmiczną technologię by ocalić życie matki, Ianto, który urzekł Jacka znakomitą kawą i talentem do łapania kosmitów, oraz medyczne odkrycie, które zmieniło sposób, w jaki Owen widzi świat.

Odcinek 13

Kapitan John Hart powraca by zemścić się na oddziale. Bierze w niewolę Jacka i wysyła go daleko w przeszłość. Torchwood, pozbawiony dowódcy, musi poradzić sobie z sytuacją w mieście, które znalazło się na skraju zagłady. Dla kogo tak naprawdę pracuje Kapitan John? Czy można mu ufać? I jak wielką cenę Torchwood będzie musiał zapłacić za ocalenie miasta?